Zulkifli merupakan pengasas dan pengasuh kepada Pondok Baitul Qurro' Wal Fuqoha' semenjak tahun 2000. Beliau merupakan Timbalan Pesuruhjaya 3 PAS Negeri Melaka. Beliau juga diberi kepercayaan untuk memimpin Dewan Ulama PAS Negeri Melaka semenjak tahun 2006. Di peringkat PAS pusat menjadi ahli jawatankuasa Dewan Ulama PAS. Beliau pernah diberi kepercayaan oleh Dewan Ulama PAS menjadi pengerusi Lujnah Khas Sekolah-sekolah Pondok Majlis Pendidikan PAS peringkat kebangsaan. Selain mengajar di pondok dan memimpin Dewan Ulama, beliau juga bergerak sebagai pendakwah di dalam dan luar negara[1]. Beliau telah dilantik sebagai Ahli Jawatankuasa Fatwa Negeri Melaka pada tahun 2020.